Em 1902, foi nomeado Bispo de Macau e no ano seguinte trouxe consigo o seminarista teólogo José da Costa Nunes que ficou a estudar no Seminário.  Fundou o "Boletim do governo Eclesiástico da Diocese de Macau", mandou construir a igreja de S. José de Singapura e uma grande residência para os padres. convidou as Franciscanas Missionárias de Maria, a quem confíou o Colégio de Sta. Rosa de Lima e recebeu os Salesianos, a quem confiou o Orfanato da Imaculada Conceição.  No ano 1918, faleceu na residência da Penha, sendo sepultado na Gruta de Nossa Senhora de Lourdes.  Os seus restos mortais foram posteriormente trasladados para a terral natal, Pico, Açores em Portugal.